內湖區名之由來,源於境內舊地名「內湖庄」,由於區內多小盆地地形,昔皆以閩南語「湖」稱之,內湖即內方盆地之意。
內湖區在清末屬淡水縣芝蘭一堡,民國九年隸臺北州七星郡內湖庄。光復後,民國三十四年十二月改屬臺北縣七星區內湖鄉,民國三十五年七月六日,南港自內湖鄉內劃出,自行成立南港鎮,內湖鄉行政區域由是變小。民國三十六年二月四日,裁撤七星區署為臺北縣內湖鄉,鄉公所設於內湖村。民國五十七年七月一日併入臺北市為「內湖區」。